Aller au contenu principal

La niche des cellules souches dans le développement et la maladie

Meryem Baghdadi
Description de l'équipe

Notre équipe s’intéresse à la régulation du microenvironnement des cellules souches intestinales au cours du développement, de la régénération et des pathologies pédiatriques. Nous utilisons des approches multidisciplinaires, telles que les organoïdes, la microfabrication, les souris génétiquement modifiées et la multi-omique à l’échelle unicellulaire, pour étudier comment les cellules souches interagissent avec leur microenvironnement.

Le renouvellement et la régénération des tissus sont orchestrés par les cellules souches, qui assurent à la fois leur différenciation et leur auto-renouvellement. L’équilibre entre auto-renouvellement, prolifération et engagement cellulaire dépend du microenvironnement des cellules souches, ou « niche ». Toutefois, ces cellules ne sont pas de simples répondeurs passifs : elles jouent un rôle actif dans la construction et la communication avec leur environnement. L’intestin constitue un excellent modèle pour étudier la biologie des cellules souches, car il se renouvelle en continu et possède une remarquable capacité de régénération après des lésions aiguës ou chroniques. Bien que de nombreuses études aient décrit la composition moléculaire et cellulaire de la niche, il reste à comprendre si et comment les propriétés mécaniques du microenvironnement régulent l’émergence et le maintien des cellules souches.

Nos axes de recherche :

  1. Comprendre les interactions entre les cellules souches et leur niche mécanique au cours du développement
  2. Étudier le microenvironnement des cellules souches dans les maladies pédiatriques
  3. Déchiffrer les mécanismes de mécano-sensibilité impliqués dans les décisions du destin cellulaire
Publications clés
Baghdadi MB, Houtekamer RM, Perrin L, Rao-Bhatia A, Whelen M, Decker L, Bergert M, Pérez-Gonzàlez C, Bouras R, Gropplero G, Loe AKH, Afkhami-Poostchi A, Chen X, Huang X, Descroix S, Wrana JL, Diz-Muñoz A, Gloerich M, Ayyaz A, Matic Vignjevic D, Kim TH. PIEZO-dependent mechanosensing is essential for intestinal stem cell fate decision and maintenance. Science. 2024; Nov 29;386(6725):eadj7615. Epub 2024 Nov 29. doi: 10.1126/science.adj7615. PMID: 39607940 .
Baghdadi MB, Ayyaz A, Coquenlorge S, Chu B, Kumar S, Streutker C, Wrana JL, Kim TH. Enteric glial cell heterogeneity regulates intestinal stem cell niches. Cell Stem Cell. 2022; Jan 6;29(1):86-100.e6. Epub 2021 Nov 1. doi: 10.1016/j.stem.2021.10.004. PMID: 34727519 .
Baghdadi MB, Kim TH. Analysis of mouse intestinal organoid culture with conditioned media isolated from mucosal enteric glial cells. STAR Protoc. 2022; Apr 28;3(2):101351. doi: 10.1016/j.xpro.2022.101351. PMID: 35516847 ; PMCID: PMC9062428.
Baghdadi MB, Castel D, Machado L, Fukada SI, Birk DE, Relaix F, Tajbakhsh S, Mourikis P. Reciprocal signalling by Notch-Collagen V-CALCR retains muscle stem cells in their niche. Nature. 2018; May;557(7707):714-718. Epub 2018 May 23. doi: 10.1038/s41586-018-0144-9. PMID: 29795344 ; PMCID: PMC5985950.
Baghdadi MB, Firmino J, Soni K, Evano B, Di Girolamo D, Mourikis P, Castel D, Tajbakhsh S. Notch-Induced miR-708 Antagonizes Satellite Cell Migration and Maintains Quiescence. Cell Stem Cell. 2018; Dec 6;23(6):859-868.e5. Epub 2018 Nov 8. doi: 10.1016/j.stem.2018.09.017. PMID: 30416072 .
Castel D, Baghdadi MB, Mella S, Gayraud-Morel B, Marty V, Cavaillé J, Antoniewski C, Tajbakhsh S. Small-RNA sequencing identifies dynamic microRNA deregulation during skeletal muscle lineage progression. Sci Rep. 2018; Mar 9;8(1):4208. doi: 10.1038/s41598-018-21991-w. PMID: 29523801 ; PMCID: PMC5844870.
Financements & subventions